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.重要流行病病原的快速诊断和检测技术
在缺乏必要的检疫手段的情况下，养殖品种的盲目引进和交换是造成重大流行病发生和发展的巨大隐患。快速简便的诊断技术在生产上的应用，可以防患于未然，并为治疗提供科学依据。
目前免疫荧光技术，单克隆抗体技术，酶联免疫技术(如：ELISA、DOT-ELISA)及DNA探针技术在鱼类尤其是淡水鱼类病毒及细菌诊检方面已比较成熟。对虾病毒病的研究重点还是在检测诊断上，美国的Lighter等(1994)综述了国际上对虾病毒病的研究发展现状，除传统的组织病理学检测、电镜观察外，免疫荧光抗体、ELISA技术外，DNA探针、PCR技术也开始应用于对虾病毒的检测上。国外有关对虾BP、IHHNV和MBV等病毒检测的DNA探针已研制成功，在美国检测IHHNV病毒的DNA探针已进入商用阶段。我国对虾病毒病的研究虽起步较晚，但也取得了相当进展，特别是对我国对虾危害最大的皮下及造血组织坏死杆状病毒(HHNBV)的研究上，已成功研制出特异性和灵敏度高的PCR检测技术。只有检测技术逐渐有所突破，流行途径及防治技术的研究才有可能随之深入。
重要病原体的体外培养及保存技术是研究病原诊断和病害防治的必不可少的技术基础。国外已经培养和建立了一些海水养殖鱼类的细胞株，美国和我国台湾省在斑节对虾细胞培养方面已取得了一些进展，并利用培养的对虾细胞成功地进行了病毒MBV的体外感染。我国大陆在这方面基础比较薄弱，但在淡水生物方面，在欧共体援助下，已建成具有标准病毒、标准抗血清及现代化实验设备的病毒和免疫实验室，拥有数十种鱼类细胞株，并已开展海洋生物病害的研究。
2.无特定病原(specific PAthogens Free SPF)苗种生产技术
对虾是我国海水养殖的当家种类之一。对虾养殖业的兴起为我国沿海农村经济的发展作出过重大贡献。但由于对虾养殖规模的盲目扩大，使有限的环境容量难负重荷，加上对虾养殖的管理水平一直不高，对于虾苗的引进和南北交流基本上是放任自流，加之对虾病害基础研究的忽视使我们又缺乏必要的技术储备，因而面对1993年对虾病害的大爆发无计可施，损失十分惨重。优质健康种苗的培育也缺乏深入系统的研究，这显然是我们控制对虾病害的一个最薄弱的环节。
无特定病原(specific PAthogens Free SPF)虾苗种生产技术的应用是控制病害发生的有效手段。近年来，美国采用培养无特定病原SPF虾，生产了不带IHHNV、HPV、BP病毒，微孢子虫、簇虫、线虫和绦虫等特异性病原的南美白对虾种苗，使对虾产量在不增加养殖面积的基础上增产了一倍。我国也应采用快速诊断和检测技术，严格挑选亲体和苗种，建立不带特异性病原如造成重大病害的病毒的种苗生产系统，除对虾外，鱼类和贝类都要逐步推广SPF苗种生产。
3.高健康养殖系统（Hhigh HeAlth Shrimp System,HHSS）
高健康养殖系统（Hhigh HeAlth Shrimp System,HHSS）是几年前由美国首先提出的，它是对虾养殖和虾病控制的系统工程，涉及到种苗培育和供应，虾病检测与控制、环境质量控制以及养殖技术的改进等几个环节。美国高健康对虾养殖系统已实施数年，该系统将先进的病毒性疾病监控与培育高度健康、优质、无特定病毒病原的虾苗及环境质量监控、养殖操作技术改良融于一体，已经达到持续受益的效果。所谓高健康的虾，Pruder等定义为从育苗场产出的没有特定病原的虾。为了了解虾苗离开育苗场后的状态，建立了病原连续监控系统，包括新病原的不断发展。美国主要对虾养殖种类是南美白对虾(P.vAnnAmei)，对其主要致病病毒包括传染性皮下及造血组织坏死病毒(IHHNV)、对虾杆状病毒(BP)、肝胰腺细小病毒(HPV)及TAurA综合症病毒(TSV)进行了详细研究，除新近发现的TSV外，其它主要致病病毒如IHHNV，BP及HPV的基因组已部分克隆，建立了核酸探针杂交技术包括斑点杂交及原位杂交及PCR检测技术，并常规应用于P.vAnnAmei的病毒病检疫及诊断，同时对这些主要致病病毒的理化特性、致病性及传播途径的研究也已非常深入。这保证了美国P.vAnnAmei高健康育苗系统的成功，而其它国家尚无成功范例。
对虾病毒病害的防治是一个综合课题，其中病毒病原学研究包括病毒分离鉴定、致病力、流行传播途径及检测技术的建立是基础，与优质、高产、抗逆对虾苗种培育及环境质量监控改善等结合在一起，采取生物高新技术综合防治系统工程，才能从根本上解决困扰养虾业的病毒病害问题，使我国对虾养殖业恢复世界领先地位，并能保持长久、健康的发展。
4.重大流行病的免疫预防技术
虽然鱼、虾、贝类，尤其是虾、贝类等无脊椎动物特异性免疫机能不够健全，但在抵抗疾病感染的过程中非特异性免疫机制仍发挥作用。近年来，有关鱼的防病疫苗和虾类的免疫激活剂如肽聚糖等多糖的研制已取得了很大进展，有的已经商品化如挪威鱼类弧菌疫苗已得到广泛运用，并在生产应用中取得了显著的预防效果。国内在鱼、虾免疫防治药物和疫苗的研制中也取得了一些进展，开展海水养殖鱼、虾、贝类免疫激活剂和重要疾病的疫苗研制，有效药物的筛选和缓释高效型药物的高新技术研究应引起足够的重视。
三、高效全价饵料生产及水产品加工技术
制约海水养殖发展的另一因素是人工饵料的贫乏，各种动物的幼体不同阶段需要成分各异、形式特殊的饵料。鱼虾的养成，更需要大量营养丰富、效价较高的饵料。国外已发展了适合不同动物不同幼体阶段的开口饵料及育幼饵料，养成饵料特别注重转换率、稳定性。加拿大的鲑鳟鱼养成饵料转换率接近1∶1。
生物活饵料，包括植物性的单胞藻，动物中的轮虫、卤虫以及小型桡足类等是水产养殖中必不可少的优良饵料，不仅含有各种必需的营养成分，还具有适口性和不易败坏水质等优点。大规模、高效率生产各种活饵料涉及到很多生物技术，如利用生物反应器大规模培养单胞藻或轮虫，以藻膏形式保存和运输单胞藻，营养强化单胞藻或轮虫，遗传选育小型或超小型轮虫以满足特殊养殖动物开口饵料的需求等。水产品的加工是提高附加值、高效利用资源的重要手段，除了加工机械外，加工工艺也至关重要，如挪威利用酶试剂来去掉水产品的皮膜，日本根据海珍品的特殊风味，利用低值水产品生产海珍品的仿制品等。我国的科学家和企业家对此予以高度重视，螺旋藻的深加工和粗制鱼油加工成高度不饱和脂肪酸EPA、DHA就是成功的范例。
四、育苗及养殖环境改善及优化技术
确保海水养殖业持续发展的另一个重要问题是养殖环境的改善与保护。首先要从大生态系的角度防止海水养殖环境的污染与恶化，此外从养殖生态系本身的改善，构建良性的人工生态系统，实施高产、稳产。两个方面都需要借助生物技术手段，建立起环境监测与污染防治的生物工程系统。海洋环境的监测与改善需要若干高新技术，考虑到大环境的问题在别的主题已有考虑，本文仅就育苗与养殖的环境进行论述。
众所周知，育苗与养殖环境已成为制约海水养殖和造成病害的重要因素，当前国际上围绕着该问题正在开发若干新技术。首先是环境的自动监测与预警系统，要动态地反应出育苗与养殖环境的变化，尽早地对不可承受状态提出预警，国外除采用各种传感器来测定环境的理化、生物因子外，还利用贻贝等生物作为指示器来预警预报。在治理上，针对赤潮生物、过多的重金属离子和过多的营养盐等进行控制，给育苗和养殖创造一个最佳的生存环境，大幅度提高了育苗成功率和养成产量。此外，育苗与养殖海水的封闭循环，是减少污染、节约能源与用水的重要举措，各国都在加紧开发。
21世纪，有人预言是海洋世纪，在合理开发利用海洋生物资源、发展海洋经济和保护海洋环境中，海洋生物技术是大有作为的。